Estudo: Catálogo de variações do DNA ajuda a encontrar raízes da doença

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Anonim

Um enorme catálogo de DNA humano está ajudando os pesquisadores a encontrar pequenas falhas que causam doenças, em parte apontando algumas pistas falsas.

O banco de dados, com códigos genéticos de mais de 60.000 pessoas, tem como objetivo pesquisar doenças raras que geralmente são causadas por um único gene com mau funcionamento. A maioria dessas doenças é tão incomum que o público em geral nunca ouviu falar delas, mas existem milhares dessas condições e, como um grupo, elas afetam cerca de 1% dos nascimentos.

A melhor precisão na identificação da causa genética da doença de uma pessoa proporciona um "benefício claro e direto aos pacientes", disse Daniel MacArthur, do Broad Institute, em Cambridge, Massachusetts, e Massachusetts General Hospital, em Boston.

Ele é autor sênior de uma análise publicada na revista Nature por pesquisadores que compilaram o banco de dados, que se baseia em dados de DNA de mais de duas dúzias de estudos sobre doenças. Ele entrou em operação em 2014 e desde então tem sido consultado mais de 5 milhões de vezes, disse ele.

Para doenças raras, os médicos tentam encontrar a causa genética analisando o DNA do paciente. Mas todo mundo carrega dezenas de milhares de minúsculas diferenças em relação ao código padrão do DNA, e o objetivo é descobrir qual deles está deixando a pessoa doente.

Pesquisadores freqüentemente fazem isso através de culpa por associação. Se uma variação aparece em um paciente, mas nunca é vista ou extremamente rara em outros, pode ser apontada como a causa da doença.

O desafio é conseguir DNA suficiente do público em geral. Se a amostragem for muito pequena ou não for suficientemente abrangente para populações diversas, uma variante pode ser injustamente culpada como a causa dos problemas do paciente. Uma amostragem melhor pode mostrar que a variante realmente aparece em pessoas saudáveis ​​com freqüência suficiente para que não esteja deixando ninguém doente.

Falsas ligações podem prejudicar o atendimento ao paciente, incluindo, em alguns casos, a falta de tratamentos, disse MacArthur.

Um exemplo de tal "diagnóstico errôneo genético" foi apresentado na quarta-feira em um estudo não relacionado no New England Journal of Medicine . Concentrou-se em uma doença hereditária chamada cardiomiopatia hipertrófica, que engrossa o músculo cardíaco e pode interferir no bombeamento do sangue.

Examinando três anos de registros de um laboratório de testes, descobriu-se que sete pacientes foram informados de que carregavam uma das duas variantes de DNA que haviam sido associadas à doença cardíaca. Ambas as variantes foram posteriormente reclassificadas como benignas.

Pelo menos cinco dos pacientes eram de ascendência africana. Se os estudos originais dessas variantes tivessem incluído americanos negros suficientes em suas amostras, eles provavelmente não teriam chegado à conclusão errada, disseram os pesquisadores de Harvard.

Eles disseram que o novo catálogo de DNA, apelidado de ExAC, está bem equipado para evitar tais erros. Ele fornece uma coleção de variações de DNA muito mais abrangente do que a disponível no passado. As cerca de 10 milhões de pequenas variações listadas são de pessoas de ascendência européia, africana, sul-asiática, oriental e latina.

Em um estudo separado, divulgado na quarta-feira pela revista Genetics in Medicine, autores britânicos usaram dados do ExAC para lançar dúvidas sobre relatos recentes que implicaram alguns genes na cardiomiopatia hipertrófica e uma segunda doença do músculo cardíaco.

A análise na Nature forneceu outro exemplo de como o ExAC pode apontar os erros do passado. Os pesquisadores analisaram 192 variações de DNA que tinham sido associadas a doenças, mas que o ExAC mostrou serem realmente tão comuns na população geral que esses elos pareciam espúrios.

Os pesquisadores descobriram que, de acordo com os critérios padrão, pelo menos 163 deveriam ser reclassificados como benignos ou provavelmente benignos. Em dezembro passado, 126 haviam sido reclassificados, relataram os pesquisadores. Isso provavelmente reflete a influência do banco de dados ExAC, disse MacArthur.

Mas bancos de dados ainda maiores que o ExAC serão necessários para ligar decisivamente as variações genéticas às doenças ou descartá-las, disse ele. "Temos um longo caminho a percorrer", disse ele.

Jay Shendure, especialista em genética da Universidade de Washington, em Seattle, que não participou do novo trabalho, disse que o catálogo da ExAC oferece vantagens em relação aos bancos de dados anteriores. Há "pouca dúvida" de que irá acelerar e refinar a busca por causas de doenças e aspectos genéticos do atendimento ao paciente, escreveu ele em um comentário da Nature .